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50K液相芯片背景介绍

玉米 (Zea mays L.) 是杂种优势利用最典型、最成功的作物。为适应新时期玉米育种发展要求,增强我国玉米新品种培育的自主创新能力,促进我国玉米种业发展,中玉金标记在玉米品种改良、分子辅助育种、全基因组选择育种等方面提供一体化、平台型分子育种服务解决方案。

中玉金标记玉米基因组产品线持续迭代更新,在玉米 10K 育种芯片、玉米 56K 基因芯片技术积累基础上,重磅推出 "芯" 成员 ——玉米 50K 液相中高密度精准芯片。芯片位点精选自 CGMB Maize 56K 基因芯片核心标记及数百份代表性玉米全基因组重测序数据,专为玉米分子育种与科研应用量身打造。


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产品应用场景
序号 应用场景 核心内容价值定位
1 全基因组关联分析(GWAS) 挖掘玉米表型与基因型关联,解析产量、抗逆等性状遗传机制助力性状遗传本质解析
2 QTL定位、 BSA分析 精准锁定玉米优势性状数量性状位点,通过集群分离分析加速性筛选高效定位优良性状遗传位点
3 遗传图谱构建 解析玉米基因组遗传标记连锁关系,搭建分子育种“遗传冒架”夯实分子育种技术基础
4 遗传多样性和群体进化分析 探究玉米种质资源遗传差异与进化历史,支撑种质创新与利用驱动种质资源高效开发
5 分子标记辅助育种、全基因组选择育种 借助分子标记精准选择优良性状,结合全基因组层面高效选育玉米新品种实现精准、高效育种突破
6 杂种优势群划分,群体结构及亲缘关系分析 划分玉米杂交亲本优势群,解析群体遗传结构,助力强优势杂交组合选育加速强优势杂交种创制

           
核心优势
  • 适用于不同玉米材料

    挑选位点来源于超2万份以上国内外玉米种质材料验证,及新的代表性重测序数据;包含代表温带种质材料和热带种质材料的多态性位点;

  • 标记探针丰富多态性高

    总标记探针数 47827个,Gene区探针数29028 个,遴选高多态性 SNP 位点,且在基因组里均匀分布,同时加入品种确权核心位点。

  • 液相芯片升级更灵活,产品迭代效率再提升

    根据最新科研成果,每次版本迭代都会升级前景及背景标记,使该款芯片持续保持竞争力。

  • 成本低、检测通量高

    以二代测序技术为基础,依托中玉金标记自研捕获探针试剂盒及配套试剂,探针区域捕获2*150bp测序,检出位点比50K探针数量更多,满足育种场景的高性价比首选。

  • 分型数据稳定精准

    分型重复性、位点检出率表现优异,可稳定支撑亲本选配、回交背景纯化、dh 系筛选、群体 gwas 分析、遗传进化解析等全链条分子育种工作;数据格式通用,可直接对接各类育种分析软件,数据复用性强。

  • 满足育种合规应用

    集成品种真实性、实质性派生品种判定核心位点,分型数据可用于品种指纹构建、种质确权、新品种申报相关工作,支撑育种合规化管理。

技术优势
  • 平台支撑优势
    拥有 NGS 测序、基因芯片、KASP 分型、高通量DNA提取等多技术平台,覆盖全基因组扫描、高通量分型及靶向验证。各平台数据兼容,可无缝对接 GWAS 分析,数据质量稳定、重复性好。
  • 技术精准优势
    依托高通量基因分型(测序 / 芯片)与 KASP 靶向验证的协同机制,显著提升 GWAS 关联位点定位的准确性,降低假阳性率,保证分子标记从发现到验证全程可信。
  • 场景适配优势
    灵活适配动植物多种物种,兼容大、小群体规模,可根据项目特点匹配合适的技术路径,满足不同育种阶段和科研方向的个性化需求。
  • 服务保障优势
    提供从样本处理、检测分析到报告交付的全流程服务,专业团队 1 对 1 对接,配套标准化报告,助力科研成果快速转化为育种生产力。
  • 育种转化优势
    GWAS 挖掘的关联位点及分子标记,可直接对接 MAS、全基因组选择等育种流程,助力缩短育种周期、降低田间测试成本,推动传统育种模式向精准分子育种升级。
  • 数据分析优势
    拥有专业生物信息分析团队,优化 GWAS 分析算法,提升 QTL 检测效率与遗传力解释率,精准挖掘高价值候选基因,为育种决策提供科学数据支撑。
产品技术表现
  • 47,827
    位点分布均匀

    47,827个SNP位点在玉米10条染色体上均匀分布,0.1Mb窗口内位点密度合理,无明显富集成缺失区域

  • 99.86%
    检测重复性好

    重复样本基因型一致性最高达99.86%,平均一致性超过98%,数据稳定可掌

  • 98%+
    位点检出率高

    位点检出率稳定在98%以上,群体结构清晰可准确区分不同杂种优势群的玉米材料

相关案例
服务流程
送样提取质检
接收叶片、种子等各类玉米样本,采用标准化流程高效提取高质量基因组 DNA,进行浓度、纯度双重严格质检。
捕获建库
使用自研液相捕获探针进行目标区域杂交富集,完成片段化、末端修复、接头连接等步骤,构建高质量测序文库。
高通量测序
采用华大T7主流测序平台进行双端 150bp 测序,保证足够的测序深度和数据质量。
数据质控
对原始测序数据进行严格质控,去除低质量序列和接头污染,确保后续分析结果的准确性。
生信分析
通过标准化生物信息学分析流程,完成序列比对、变异检测、基因型分型,提供完整的分析结果和可视化报告。
常见问题(FAQ)
1.什么是玉米 50K 液相中高密度精准芯片?

答: 玉米 50K 液相高密度精准芯片是中玉金标记基于液相靶向捕获测序技术开发的新一代玉米基因分型工具,整合了 CGMB Maize 56K 基因芯片核心标记及数百份代表性玉米全基因组重测序数据,专为玉米分子育种与科研应用量身打造。

2. 这款芯片和之前的玉米 10K、56K 芯片有什么关系?

答: 它是中玉金标记玉米基因组产品线的迭代升级产品,继承了玉米 10K 育种芯片的实用性和玉米 56K 基因芯片的位点丰富性,同时结合液相技术优势,在灵活性、成本和迭代速度上实现了全面提升。

3. 玉米 50K 液相芯片总共有多少个位点?功能位点占比多少?

答: 总标记探针数 47827 个,其中 Gene 区功能探针数 29028 个,占比超过 60%,同时包含品种确权核心位点,兼顾科研与育种双重需求。

4. 芯片的检测准确率和重复性怎么样?

答: 重复样本基因型一致性最高达 99.86%,平均一致性超过 98%,位点检出率稳定在 98% 以上,数据质量可靠。

5. 检测周期是多久?

答: 从收到合格样本到交付完整分析报告,标准周期为 10-15 个工作日;批量样本可根据项目规模协商加急交付。

6. 对送检样本有什么要求?

答: 可接收叶片、种子、幼苗等各类玉米组织样本,也可接收客户提取好的 DNA 样本。DNA 样本要求浓度≥10ng/μL,总量≥20μL,纯度 OD260/280 在 1.8-2.0 之间。

7. 检测完成后会交付哪些数据和报告?

答: 会交付原始测序数据、标准化基因型分型结果文件(VCF/Excel 格式)、位点质量报告、样本遗传多样性分析报告,以及定制化的 GWAS、QTL 定位等专项分析报告。

8. 和其它液相玉米芯片相比有什么优势?

答: 位点基于国内海量育种数据筛选,更贴合中国玉米种质资源特点;拥有自研捕获探针试剂盒,成本更低;提供本土化全流程服务,响应速度更快,售后服务更有保障。