BSA（Bulked Segregant Analysis，混合分组分析法/集群分离分析法）是1991年Michlmore等首次提出的一种利用极端性状进行功能基因定位的高效方法，已广泛应用于动植物分子育种领域，2015年日本科学家便利用该方法定位到水稻耐盐性状基因，成功研制耐盐新品种并推广种植。中玉金标记依托自身成熟的分子生物技术平台，结合英国LGC公司KASP标记技术优势，打造专业化BSA性状定位分析方案，可快速、精准定位控制目标性状（如抗性、产量、品质等）的基因位点，为作物遗传育种、基因克隆及功能研究提供核心技术支撑，助力科研工作者缩短育种周期、降低研究成本。
BSA核心原理是利用表型极端差异的亲本构建性状分离家系群体，从子代分离群体中选取极端表型个体（如高抗/高感、早熟/晚熟、高产品种/低产品种），分别混合等量基因组DNA构建两个“近等基因池”（目标性状池与对照性状池），通过全基因组重测序技术，检测两个基因池间的SNP、InDel等分子标记差异，结合生物信息学分析锁定与目标性状紧密关联的基因位点或染色体区间。
中玉金标记BSA分析可适配四种核心技术路径，分别为MutMap、MutMap+、MutMap-Gap、QTL-seq，四种技术原理一致但适用场景不同，可根据用户实验材料类型灵活选择，同时结合KASP标记开发技术，进一步提升标记转化成功率和分型准确性，保障定位结果的可靠性。
多技术融合
分析方法灵活
定位精准高效
专业化团队
性价比突出
应用广泛
| 序号 | 分析名称 | 分析内容 |
| 1 | 测序数据质控 | 过滤低质量 reads、接头序列，统计测序深度、覆盖度 |
| 2 | 序列比对 | 与参考基因组比对，分析比对率、覆盖度，去除重复序列 |
| 3 | 变异检测与注释 | 检测 SNP、InDel 变异位点，ANNOVAR 功能注释，筛选有意义变异 |
| 4 | 性状关联分析 | 计算 SNP‑index 及 ΔSNP‑index，1Mb 窗口 1kb 步长作图，选 95% 置信水平窗口为候选区间 |
| 5 | 候选基因分析 | 候选区间基因功能注释、GO/KEGG 富集分析，筛选候选基因 |
| 6 | 高级分析（可选） | 亲本 InDel 标记开发、PCR 引物设计、候选基因表达量分析（限两亲本，需参考基因组注释文件） |
答：BSA建池时仅针对目标性状选择极端个体，确保两个混池的遗传背景基本一致，仅在目标基因区段存在差异（即近等基因池），排除环境及人为因素影响，可精准锁定与目标性状关联的位点，且无需构建遗传图谱，省时省力。
答：不推荐。针对微效多基因控制的数量性状，简化基因组可能遗漏大部分关联位点；针对质量性状或主效基因控制的数量性状，简化基因组BSA的风险更高，建议采用全基因组重测序进行BSA分析。
答：根据计算的SNP-index和ΔSNP-index，选取置信水平以上的窗口作为候选区间；筛选在外显子上引起非同义突变、stop gain或stop loss的SNP/InDel作为候选变异位点，其所在的基因即为候选基因，同时结合基因功能注释进一步筛选。
答：标准周期为30个工作日，若样品数量较少、分析需求简单，可与技术团队沟通，在保证分析质量的前提下适当缩短周期。
答：可提供候选基因克隆、KASP标记开发与验证、RT-PCR表达分析、RNAi功能验证等后续服务，一站式解决用户从性状定位到基因验证的全流程需求。