中玉金标记（北京）生物技术股份有限公司 中玉金标记（北京）生物技术股份有限公司
高通量DNA提取 SNP分型 芯⽚定制 芯⽚检测 NGS测序
KASP平台介绍 KASP特点与优势 KASP应用案例 KASP标记开发及检测介绍
芯⽚平台介绍 固相基因芯⽚定制 液相捕获芯片定制 KASP Panel定制
产品
全基因组重测序 GWAS分析 BSA性状定位 QTL定位 遗传图谱 群体进化 低深度重测序

科研解决方案

KASP产品简介

KASP即竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive Allele Specific PCR)，可在广泛的基因组DNA样品中(甚至是一些复杂基因组的DNA样品)，对SNPS和特定位点上的InDels进行精准的双等位基因判断。

以KASP为核心技术，提供灵活适用的基因型分析解决方案,用于基因型分型分析、KASP Assav的研发、NGS之后的SNP验证和农业种群研究等。由于其高通量、低成本和检测效率高等优点，KASP技术在农作物性状遗传和改良研究领域备受关注，现已在全球广泛应用。

应用领域包括


技术原理及流程

KASP产品特点

  • 开发简便

    KASP标记设计对两条等位位点引物和一条通用引物即可，开发流程简洁、周期短、成本低。

  • 检测高效

    中玉金标记KASP基于荧光分型,结合微量反应的LGC SNPline和Douglas Scientific Array Tape全自动基因分型平台,检测快速、准确、成本低。

  • 灵活性高

    可根据不同研究需求和实验设计灵活选择检测位点和样本，满足个性化的科研需求，并可在qPCR仪灵活调整。

  • 样本适用性广

    样本类型涵盖植物、动物、人类及海洋生物等,对各种复杂样本具有良好的适应性,能够满足不同研究领域和应用场景的需求。

  • 结果呈现清晰

    KASP基因分型技术的结果为清晰的基因分型散点图，不同的SNP基因型对应不同的荧光产物，易于读取和分析，数据的可靠性高

  • 价格低

    检测价格低至1元人民币/标记起，检测量大价格更优
KASP产品优势
  • 专业团队
    拥有专业的技术人员和科研团队，具备深厚的专业知识和实践经验，KASP试剂经过特别优化，位点特异性扩增强、标记转化率高，可达到90%以上。
  • 高效的实验流程
    从样本接收到DNA提取、质检、上机检测,再到下机数据交付，整个流程高效快捷,只需要5天左右的时间。相比一些传统的基因分型技术,如测序法等,其检测周期大大缩短,能够快速为研究者提供基因分型结果,加快研究进程。
  • 大量验证
    经过大量样本的检测验证,该平台能够保持高度的准确性和稳定性,对于复杂基因组样本中的SNP和特定位点上的InDels也能实现精准分型。
  • 经验丰富
    公司构建了在线数据库可以帮助序列评估和大量的的引物设计,针对开发难度大的引物,我们有丰富的经验手工辅助设计,提高引物设计的成功率。
  • 高能量检测能力
    配备先进的Douglas系统工作站和LGC通量检测设备,日检测通量可达10万份,确保检测结果的准确性和可靠性。
  • 严格的质量控制
    在实验过程中，平台可能具有严格的质量控制体系，对每个环节进行监控和检测，确保数据的准确性和可靠性。结合标记/DSA 存储系统STT3K0、LCG Kraken/Douglas Scientific Interllics 管理系统以及StarLIMS实验室信息管理系统，从样品提交到基因分型。全流程自动化数据跟踪，数据出错概率小，追溯性强。
KASP检测设备

结果展示

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KASP应用案例
KASP技术在种质资源鉴定及亲缘关系研究中的应用

江苏省农业科学院赵涵团队利用不同来源的玉米自交系,通过全基因组重测序数据鉴定出了一系列SNPS位点并开发出700对KASP分子标记,从中选择验证过的202对KASP标记用于系统进化树构建及群体结构分析。结果显示，基于KASP标记位点和基于总SNPS位点的聚类分析结果高度吻合,两者的遗传距离相似性系数高达89.5%,能成功区分玉米的杂种优势群。此套KASP标记可在玉米种质资源分析、连锁群构建以及杂种优势群划分等方面发挥重要作用。


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KASP技术在分子辅助育种中的应用
案例一

北京农林科学院玉米研究所赵久然团队利用B73x高油玉米的F2:3分离群体、BSR-seg及基因等位性测验技术进行分析,发现su1和sh2-R分别提高玉米籽粒含油率4.20个百分点和7.66个百分点,根据这两个基因的关键突变位点开发了基因功能性KASP标记,能够成功区分183份玉米材料中su1su1Sh2Sh2、Su1Su1sh2sh2和su1su1sh2sh2不同突变类型,对高油甜玉米育种具有重要的应用价值。发现候选基因GRMZM2G176998(WD40类B-螺旋重复蛋白).GRMZG2G021339(homeobox转录因子)和GRMZM2G167438(3-酮酰基-COA合成酶)的KASP标记与分离群体中单株的籽粒含油量显著相关。


参考文献
Luo MJ, Lu BS, Shi YX, et al. Genetic basis of the oil biosynthesis in ultra-high-oil maize grains with an oil content exceeding 20%. Front Plant Sci, 2023, 14:1168216.
案例二

美国俄克拉荷马州立大学Yan Liuling团队针对小麦抗叶锈基因Lr34 开发了两对KASP 标记：Lr34-E11-KASP 和Lr34-E22-KASP，此两对标记可在小麦育种工作中加速对Lr34 基因的选择。

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参考文献
Fang TL, Lei L, Li GQ, et al. Development and deployment of KASP markers for multiple alleles of Lr34 in wheat［J］. Theor Appl Genet, 2020, 133（7）：2183-2195.
KASP技术在遗传图谱构建与基因定位中的应用

中国农科院刘录祥课题组利用由中玉金标记独家代理的小麦55K芯片对突变体eh1 和LX987及其杂交获得的207个RIL进行遗传作图，共检测到37个QTL，分别与抽穗期、株高、千粒重、穗长等农艺性状相关，并成功开发了25对KASP标记。利用 400 个 RIL 对 3A、4B 和 6A 染色体上稳定检测到的 QTL 进行验证。将4B染色体上控制株高和千粒重的 QTL 簇界定在一个 0.8 Mb 的物理区间内，3A 染色体上控制抽穗期的 QTL 被缩小到 2.5 Mb 的区间。 

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参考文献
Xiong HC, Li YT, Guo HJ, et al. Genetic mapping by integration of 55K SNP array and KASP markers reveals candidate genes for important agronomic traits in hexaploid wheat［J］. Front Plant Sci, 2021, 12 ：628478.
KASP技术在种子纯度鉴定中的应用

北京市农林科学院玉米研究所王蕊、施建龙、田红丽等基于12套杂交种及其父母本的三联体样本及335 份玉米杂交种国家审定标准样品SNP 指纹, 从384 个SNP 基础位点筛选获得60 个候选位点, 位点转化为KASP 引物的成功率为95%。综合考虑标记双亲互补率、多态性、稳定性和分型效果等多项指标，最终确定20个标记作为玉米杂交种纯度鉴定的核心标记，这些标记能够有效鉴定99.7%供试样品纯度。


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图 测试引物分型效果图


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参考文献
王蕊，施龙建,田红丽等. 玉米杂交种纯度鉴定SNP 核心引物的确定及高通量检测方案的建立［J］. 作物学报, 2021, 47（4）：770-779.
KASP标记开发及检测

近几年,国内外不少学者将KASP技术应用在牛、羊等家畜的产乳、生长繁殖等生产性状基因SNP位点挖掘及遗传疾病鉴定方面,且取得了不错的进展。随着KASP技术逐渐成熟,该技术对动物资源的筛选鉴定及改良具有巨大应用潜力。

案例一

Kusza等使用KASP技术对罗马尼亚饲养的法国阿尔卑斯山和萨南山羊的40个基因的48个SNF进行了初步研究,还分析了13个多态性遗传变异与羊奶产量和成分的关联情况。该研究为山羊产业中SNP标记辅助选择育种的发展提供了新的见解，并证实了使用GHRHR、ILIRN、SOCS3和IL15RA基因的SNP位点作为分子育种标记的潜力。

参考文献
Kusza S, Cziszter L T, lie D E,et al. Kompetitive Allele Specific PCR(KASP) genotyping of 48 polymorphisms at different caprine loci in Frmench Alpine and Sannen goat breeds and their association with milk composition [J]. PeerJ,2018,6,e4416.
案例二

产乳性状是奶牛的重要经济性状,数量遗传学认为产乳性状(包括产乳量,乳脂量、蛋白含量、乳,脂率、蛋白率等)是由微效多基因决定的数量性状,也是分子标记辅助选择的理想性状之一。武泽文等为了筛选B型-酪蛋白A2纯合基因型荷斯坦奶牛,在奶牛场进行KASP基因分型,结果成功检测到A2纯合基因型。研究结果显示,宁夏地区荷斯坦奶牛A2纯合基因型奶牛占38.49%,A1纯合基因型奶牛占13.29%,A1A2杂合基因型奶牛占48.21%,A2纯合基因型奶牛占全群分之一以上。说明KASP方法可以高效快速地对奶牛基因型进行筛选,并且该方法比PCR-SSCP(单链构象多态性)、基因芯片等方法更适合大样本检测高产奶BB基因型奶牛个体。

表 玉米杂交种纯度鉴定SNP 核心引物信息表

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参考文献
武泽文，顾亚玲，张娟等，A2纯合基因型荷斯坦奶牛的筛选[J]。黑龙江畜牧兽医，2019（8）:44-47。